一码通账户和证券账户的区别是：投资者的一码通账户，将投资者的不同的证券账户统一关联到一码通账户下，即一码通账户是记载投资者证券持有及变动总体情况的账户，现有证券账户是记载投资者参与单个交易场所及投资特定交易品种的具体的证券子账户。
其中证券子账户包括A股账户、B股账户、衍生品合约账户、封闭式基金账户以及中国结算根据业务需要设立的其它证券账户。
投资者可以有多个一码通账户。同一投资者多个一码通账户与不同证券公司建立委托交易关系的，投资者可以选择证券子账户全转挂至一个一码通账户，并注销其它一码通账户;同时，同一投资者多个一码通账户均与同一证券公司建立委托交易关系的，也可以选择将证券子账户全转挂至一个一码通账户，并注销其它一码通账户。
